Las Bacterias de Biorremediación  ayudan enormemente a aliviar las difíciles condiciones del estanque circular para tilapia o camaron  pues la piscicultura con una tecnología es muy prometedora.

La piscicultura intensiva producen grandes cantidades de desechos orgánicos. Gran parte de estos materiales de desecho orgánicos se acumulan en el fondo del estanque y no puede ser utilizado por el fitoplancton.

La oxidación de estos compuestos de residuos orgánicos reduce el nivel de oxígeno disuelto en los suelos profundos fondo del estanque, y alienta la formación de metabolitos tóxicos como el sulfuro de hidrógeno, amonía y nitrito. En esas situaciones aumenta las tasas de mortalidad en el cultivo de la acuicultura.

Un procedimiento común utilizado para mejorar la calidad del agua - y por lo tanto el entorno inmediato de peces y camarones - es la aplicación directa de los probióticos a los estanques.
Esta forma de la biotecnología, también conocida como "biorremediación", implica la manipulación de microorganismos en los estanques para reducir patógenos bacterias, aumentar la mineralización de la materia orgánica, y eliminar los desechos compuestos no deseados.

Los probioticos mantienen los tres estratos totalmente equilibrados tanto en el agua, dieta y suelo,

AGUA:   en el caso de agua utilizan bacterias beneficas desplazadoras (las que compiten por espacio con vibrios),

DIETA :  en dieta usamos lactobacilus

SUELO :  en el caso de suelos usamos nitrosomonas y nitrobacters de esta manera tenemos un perfecto equilibrio en nuestro cuerpo de agua

La adición controlada de cepas beneficiosas probióticas directa o indirectamente altera la composición de la comunidad microbiótica en el ambiente de crianza.

Estas cepas también colonizan el intestino de pescado y camarón, la prevención de enfermedades intestinales y mejorar la salud animal y el rendimiento. Sus actividades microbióticas positivas incluyen la exclusión competitiva de bacterias patógenas en el intestino y el agua, fabricación de sustancias bacteriales y la degradación de los alimentos no consumidos, residuos de productos orgánicos, y la eliminación de sustancias tóxicas y olores orgánicos.

El procesos de eliminación de amonia o nitritos son importantes para la calidad del agua del estanque y se puede realizar a través de la adición de bacterias des nitrificantes autótrofos tales como Thiobacillus y Paracoccus. La biodegradación especializados Paracoccus interrumpe el ciclo de nitrógeno mediante el uso de nitratos y otros compuestos de nitrógeno oxidado en lugar de oxígeno, reduce drásticamente las cantidades de nitrógeno y compuestos de amonia.

Reacciones de reducción-oxidación inorganica producen la fuente de energía deThiobacillus con elementos como el hidrógeno o compuestos diferentes reducidos de azufre, Esto permite la eliminación de dos contaminantes (tales como H₂S y NO₃-) en un solo paso, convirtiéndolos en compuestos favorables del medio ambiente (SO₄^2- y N₂).

La adición de enzimas específicas (proteasas, amilasas, celulosas, xilanasas) puede promover la pre-digestión de ciertos nutrientes complejos y facilitar la liberación de nutrientes digestibles altamente. Como resultado, se reduce la acumulación de lodos y las condiciones anaeróbicas en el estanque de la parte inferior.